טיפול שורש הינו טיפול שיניים מקובל, בעת דלקת במוך השן, שהינה רקמת תאים רכה המורכבת מעצבים וכלי דם שנמצאת מתחת לזגוגית השן, בתוך לשכת המוך. כאשר מתפחת דלקת במוך השן, נדרש להוציא את הרקמה הנגועה בדלקת ולנקות היטב את מבנה השן הפנימי, בכדי למנוע החמרה של הדלקת והתפשטותה לאיזורי נוספים. טיפול שורש מתבצע אם כן במספר שלבים - תחילה, נדרש לבצע צילום רנטגן של השיניים או של השן החשודה, על מנת לעמוד על היקף הדלקת וחומרתה, וכן ללמוד על מבנה השן, כדי שניתן יהיה לתכנן באופן מייטבי את אופן הטיפול. בשלב הבא, המבוצע לעתים תחת הרדמה מקומית, פותח רופא השיניים פתח בזגוגית השן (החלק העליון של השן), ודרכו מסיר את מוך השן באופן מלא, ומנקה את תעלות השורש דרכן מקבלת השן הזנה מהחניכיים - בשלב זה רופא השיניים עשוי להידרש לבצע השחזה של פנים השן והתאמה של השן לסתימה הזמנית. לאחר הסרת המוך וניקוי תעלות השורש עשוי רופא השיניים להשאיר בשן חומר תרופתי כנגד הדלקת, לעתים למשך מספר ימים. השלב הבא הינו ביצוע הסתימה הזמנית, שכעבור תקופה שאינה ארוכה תוחלף בסתימה קבועה. מאחר שטיפול שורש כרוך במקרים רבים בנזק בלתי הפיך לשן, המחליש באופן משמעותי את חוזקם של קירות השן, הרי שהשן המטופלת תהיה לא אחת חשופה יותר לנזקים עתידיים וכן לשבירה או התפוררות. מסיבה זו הרופא המטפל עשוי להמליץ לא אחת על התקנת מבנה וכתר, שאמורים לצמצם סיכונים אלה תוך חיזוק השן ומתן הגנה מפני עששת. משך טיפול שורש משתנה בהתאם לכמה פרמטרים ובהם היקף הדלקת וחומרתה, מבנה השן ומספר תעלות השורש בשן, מידת נסיונו של רופא השיניים, השאלה אם נדרש מבנה או כתר ועוד. לעתים מפגש אחד או שניים יספיקו ובמקרים אחרים תידרש סדרה של טיפולים. חשוב לציין, כי טיפולי שורש רבים ניתן למנוע על ידי ביצוע בדיקות שגרתיות וטיפולי שיניים תקופתיים, שיכולים לסייע בגילוי בעיות בשיניים עוד טרם התפתחותה של הדלקת בשן - ולכן מומלץ להקפיד על ביצוע בדיקות תקופתיות באופן קבוע, שכן בדיקות אלו עשויות לחסוך כאבים וסבל וכן עלויות לא מבוטלות של טיפולים מורכבים.